Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scp2d1Q9DAH1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms