Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Speer4bQ9D9F7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4bQ9D9F7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms