Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg7Q9D906 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg7Q9D906 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms