Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D8N1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms