Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13cQ9D8D0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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