Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms