Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmigd1Q9D7L8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms