Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs6Q9D6W8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs6Q9D6W8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms