Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cmtm5Q9D6G9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cmtm5Q9D6G9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm5Q9D6G9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms