Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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