Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc130Q9D516 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms