Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1dQ9D4V4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1dQ9D4V4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1dQ9D4V4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms