Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms