Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms