Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf6Q9D4J7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf6Q9D4J7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms