Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc6Q9D4E6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms