Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933402D24RikQ9D4D3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms