Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1Q9D495 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms