Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Odf2lQ9D478 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2lQ9D478 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf2lQ9D478 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms