Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph14Q9D3W1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms