Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus10Q9D3U0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pus10Q9D3U0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus10Q9D3U0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms