Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd2Q9D3B1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd2Q9D3B1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hacd2Q9D3B1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms