Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snrnp35Q9D384 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms