Protein–RNA interactions for Protein: Q9D309

Fam3b, Protein FAM3B, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3bQ9D309 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam3bQ9D309 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam3bQ9D309 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam3bQ9D309 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam3bQ9D309 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms