Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms