Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cysrt1Q9D1E4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cysrt1Q9D1E4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cysrt1Q9D1E4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cysrt1Q9D1E4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cysrt1Q9D1E4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms