Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2cQ9D1C1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2cQ9D1C1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2cQ9D1C1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube2cQ9D1C1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube2cQ9D1C1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube2cQ9D1C1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ube2cQ9D1C1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ube2cQ9D1C1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ube2cQ9D1C1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ube2cQ9D1C1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ube2cQ9D1C1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2cQ9D1C1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ube2cQ9D1C1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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