Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca7Q9D0M2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca7Q9D0M2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca7Q9D0M2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca7Q9D0M2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms