Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zbed3Q9D0L1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms