Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mms19Q9D071 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mms19Q9D071 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms