Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc47Q9D024 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms