Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms