Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmss1Q9CZT6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms