Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3eQ9CZT4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr3eQ9CZT4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms