Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shmt2Q9CZN7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shmt2Q9CZN7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms