Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nde1Q9CZA6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms