Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rrs1Q9CYH6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrs1Q9CYH6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrs1Q9CYH6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms