Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mis12Q9CY25 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mis12Q9CY25 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mis12Q9CY25 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms