Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl11Q9CXW4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms