Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm8Q9CXT6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm8Q9CXT6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms