Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nip7Q9CXK8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nip7Q9CXK8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms