Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Sgo1Q9CXH7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Sgo1Q9CXH7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Sgo1Q9CXH7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo1Q9CXH7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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