Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Yif1bQ9CX30 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms