Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms