Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx28Q9CWT6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms