Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smyd3Q9CWR2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd3Q9CWR2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms