Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Cnot11Q9CWN7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Cnot11Q9CWN7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Cnot11Q9CWN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Cnot11Q9CWN7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Cnot11Q9CWN7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Cnot11Q9CWN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Cnot11Q9CWN7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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