Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Cnot11Q9CWN7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Cnot11Q9CWN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Cnot11Q9CWN7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot11Q9CWN7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Cnot11Q9CWN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot11Q9CWN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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