Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl3Q9CUS9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl3Q9CUS9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms