Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smurf1Q9CUN6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smurf1Q9CUN6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms