Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhobtb3Q9CTN4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms